Eigenes Template zerspringt bei Benutzung von "Permalink"

Guten Tag!

Ich arbeite gerne mit Wordpress und habe es auch so weit so gut auf meine Bedürfnisse angepasst.
Leider habe ich das Problem, dass mein Template zerspringt, wenn ich "Permalink" aktiviere.

Die Struktur lautet folgend: "/%category%/%postname%/"
Das Template ist Marke Eigenbau.

Auch funktionieren einige Plugins mit meinen Template nicht.
Dazu gehört "Featured Content Gallery"

Wie kann ich das lösen? Liegt da ein Fehler im Template? Ich habe leider keins ausmachen können.
Außerdem habe ich mein Template nach einer Anleitung von dieser Seite

Link zur Homepage: Klick


Mit freundlichen Grüßen
Aka